Tonkabönan används som doftämne i parfymer, antingen som olja eller extrakt. Bönorna fungerar som fixativ för andra doftämnen och används ofta som basnot då doften har bra långvarighet.
Tonkabönan innehåller naturlig kumarin och har historiskt använts särskilt i gröna dofter. Doften är uppiggande, söt och påminner om doften av nyslaget hö eller gräs. Extrakt av tonkabönor påminner om vanilj. Doften fungerar bra ihop med citrus, vanilj, lavendel och många söta dofter. Azzaro Pour Homme Intense, Chanel Allure Homme, Chanel Coco mademoiselle eau de parfum intense, Demeter Fragrance Flowering Tonka, Dolce & Gabbana pour Homme, Frederic Malle Iris Poudre Perfume och Jean Paul Gaultier Le Male innehåller alla tonkaböna.
